O laboratório de microbiologia é responsável por caracterizar e também identificar os microrganismos presentes em vários tipos de amostras, trabalha também para isolar os microrganismos e designa-los para análises, bem como para pesquisa e extensão. Por isso, esse laboratório deve conter equipamentos com tecnologia essencial, além do apoio de profissionais capacitados para o trabalho e materiais de qualidade.